Archives de catégorie : Emergence

SARS-CoV-2, le nouveau Coronavirus qui met le monde en émoi

Les Coronavirus tiennent leur nom de l’aspect de couronne que prend la particule virale vue au microscope électronique. Ils appartiennent à l’ordre des Nidovirales, famille des Coronaviridae, sous-famille des Coronavirinae. Cette sous famille est encore divisée en quatre genres les alpha-, beta-, gamma- et delta-coronavirus. Continuer la lecture de SARS-CoV-2, le nouveau Coronavirus qui met le monde en émoi

La rougeole dans les îles du Pacifique

Des épidémies de rougeole dans les îles Fiji, Tonga et Samoa se sont déclarées cet automne. L’île de Samoa est la plus touchée avec à ce jour (18.12.2019) 5’371 cas déclarés (Gouvernement de Samoa), dont 76 décès, principalement des enfants de moins de 5 ans. Ce taux de mortalité (1/70 cas de rougeole, soit une mortalité de 1.4%) paraît spectaculaire en regard du taux habituellement associé à un décès suite à une encéphalite rougeoleuse aigüe  dans nos contrées (1/3000, 0,033%, cf. La rougeole, faits et méfaits). Ce dernier chiffre, qui n’est déjà pas anodin, est pourtant plus de 40 fois inférieur à celui qui sévit dans les iles Samoa, en ce moment. Tentatives d’explications. Continuer la lecture de La rougeole dans les îles du Pacifique

Pandémies de grippe. Saison III: les pandémies et leur virus

Disons d’emblée qu’il ne va s’agir ici que de virus grippaux de type A dont le réservoir majoritaire se trouve dans le monde aviaire (cf. Les pandémies de grippe Saison I et Saison II). En parallèle à cette histoire de pandémies, les virus exclusivement humains de type B circulent toujours sous forme épidémique. Ces virus ne changent pas d’identité brusquement par réassortiment. Continuer la lecture de Pandémies de grippe. Saison III: les pandémies et leur virus

Pandémies de grippe. Saison II: comment une pandémie de grippe peut survenir.

La Saison I a introduit la notion de pandémie et a mentionné qu’elle survient lorsque l’immunité contre l’agent infectieux circulant n’existe pas dans la population. C’est évidemment le cas pour les pandémies causées par les virus de la grippe. Mais, d’où viennent ces nouveaux virus ? Comment sont-ils introduits dans la population humaine ? Continuer la lecture de Pandémies de grippe. Saison II: comment une pandémie de grippe peut survenir.

Pandémies de grippe. Saison I: c’est quoi une pandémie ?

On parle de pandémie lorsqu’un agent infectieux se répand sur toute la planète ou du moins sur un vaste territoire, comme un ou plusieurs continents. On la distingue de l’épidémie qui affecte des zones restreintes d’un continent, d’un pays, voire d’une région, laissant des territoires non touchés par la circulation de l’agent infectieux. Continuer la lecture de Pandémies de grippe. Saison I: c’est quoi une pandémie ?

Les faiseurs de virus

Les virus sont des organismes biologiques simples composés d’un génome qui contient toute l’information pour les reproduire, génome  entouré par une coque de protection (cf. Un virus c’est quoi). Cette forme correspond à la particule virale requise pour la transmission du virus de cellules à cellules, cellules dans lesquelles les virus se multiplient (cf. Un virus ça se multiplie comment). Les virus pour continuer à exister, ce qui constitue leur unique finalité, passent donc par des cycles obligés de transmission-multiplication. Continuer la lecture de Les faiseurs de virus

Les virus évoluent, Zika l’a fait, hélas ….

Le virus Zika est connu depuis 1947, lorsqu’il a été isolé d’un singe dans la forêt Zika en Ouganda. Pendant des décennies, il a infecté épisodiquement des humains en Afrique et dans le Sud-Est asiatique, provoquant peu de symptômes et passant de ce fait inaperçu. Ce n’est qu’en 2007 qu’il cause des épidémies ravageuses en Micronésie et plus tard, en 2013-2014, en Polynésie française. En 2015, il se répand rapidement en Amérique du Sud Continuer la lecture de Les virus évoluent, Zika l’a fait, hélas ….

Emergence d’un virus. Saison III : « Trois exemples »

Trois exemples d’émergence virale sont présentés qui ont affecté la population humaine depuis quatre décennies, quoique de manière différente. Le VIH s’est répandu sur toute la planète avec les conséquences catastrophiques que l’on sait. Le SARS-CoV a pu être maîtrisé avec des techniques apparentées à celles appliquées au Moyen-Age face aux épidémies de peste noire, alliées, il est vrai, à des méthodes diagnostiques et des moyens de communication du XXIème siècle. Continuer la lecture de Emergence d’un virus. Saison III : « Trois exemples »

Emergence d’un virus. Saison II : « Attention, incertitude majeure !!! »

L’exemple de la Saison I a illustré le potentiel d’adaptation d’un virus émergeant dans une population d’hôtes (émergence pilotée dans ce cas, mais émergence quand même) qui voit un variant mieux adapté à sa propagation dans l’espèce hôte remplacer le virus original. En l’occurrence cette adaptation a conduit à la sélection d’un virus moins virulent. Est-ce à dire qu’un virus émergeant dans l’espèce humaine ne devrait pas inquiéter. Loin s’en faut. Continuer la lecture de Emergence d’un virus. Saison II : « Attention, incertitude majeure !!! »

Virus H1N1, H3N2, H5N8 etc.. des chiffres et des lettres ?

Il y a certainement des curieux qui se sentent frustrés lorsqu’ils rencontrent au hasard d’une lecture passionnante la mention d’un virus de la grippe évoqué par son acronyme H1N1, ou H3N2 ou H3N8 etc.. Pourquoi cette formulation ? Que signifie-t-elle ? D’où vient-elle ? Continuer la lecture de Virus H1N1, H3N2, H5N8 etc.. des chiffres et des lettres ?

JO 2016, médaille d’or de la mobilité au virus Zika???

En août prochain auront lieu à Rio de Janeiro les Jeux olympiques d’été. Des dizaines de milliers d’athlètes, d’accompagnants et de fervents supporters vont donc venir au Brésil de tous les coins du monde.  Comme le Brésil est un des pays d’Amérique qui a vu émerger en 2015 puis se répandre le virus Zika (cf. Virus émergents et Le virus Zika…), il est pertinent de se demander si le retour de tous ces touristes sportifs dans leur pays d’origine ne va pas représenter une condition de dissémination du virus sur toute la planète. Continuer la lecture de JO 2016, médaille d’or de la mobilité au virus Zika???

Les virus émergents

L’actualité fait référence à l’épidémie par le virus Zika qui s’étend rapidement sur le continent Américain, remontant du Brésil aux Etats-Unis, couvrant au passage l’Amérique centrale. Laissons de côté, pour l’instant, la description du virus lui-même et les dommages qu’il pourrait occasionner, pour évoquer le phénomène plus général  de l’émergence d’un nouveau virus….. Continuer la lecture de Les virus émergents